怒江州特殊的自然环境为各种动物的生长繁衍提供了适应条件，动物资源丰富，种类繁多。哺乳类205种，鸟类525种（含亚种），爬行类动物76种，两栖类动物52种，鱼类49个种和亚种，昆虫1720多种。分布有国家一级保护动物36种，国家二级保护动物190种，省级保护动物5种，列入濒危野生动植物种国际贸易公约（CITES）附录物种19种。怒江金丝猴、戴帽叶猴、贡山麂、高黎贡羚牛、白尾稍虹雉等极小种群濒危物种主要在怒江州境内分布。
怒江州灵长类资源十分丰富，分布有怒江金丝猴、滇金丝猴、菲氏叶猴、戴帽叶猴、短尾猴、印支灰叶猴、熊猴、普通猕猴、藏酋猴、天行长臂猿、西黑冠长臂猿和白颊猕猴共12种，占中国灵长类物种29种的41.38%，占云南灵长类物种18种的66.67%，是中国灵长类动物种类分布最集中的地区。
